优先清理小怪是确保生存的关键策略。BOSS战前会出现降低怪物伤害的提示（持续30秒），需在此期间消灭所有小怪。若操作不够熟练，建议先击杀近身敌人再处理远程目标，同时保持角色位于替身草图标附近以抵消小技能伤害。群攻和远程攻击建议使用分身而非替身术规避。利用场景中的树木、石墙等障碍物卡位输出，既能保护自身又能提升战斗效率。开局时迅速释放通灵兽（如旗木五五开）并确保查克拉不空蓝，可应对突发状况，若有控制型伙伴支援则更稳妥。
通过将高战力忍者替换为低战力角色（如无饰品的4.50万战力忍者），可显著降低敌方强度。例如第一波敌人战力会从90万降至20万，后续关卡也会相应削弱。但需注意，此方法在后期40关后可能因战力不足而陷入困境，因此建议在前期使用。另一种策略是携带特定增益效果，如狂暴姿态、侵掠如火、其疾如风，配合水主毒雾普攻和神经毒素被动，能有效控制战场节奏。天赋选择上，忍术型角色优先提升忍属性（如大和忍80、幻50），而体术型角色需侧重体属性（如李洛克体90）。
面对高难度BOSS时，需精准利用大技能特性。木遁·乱杭之术可攻可守，既能先手压制突进型敌人，也能打断敌方连招。木遁·巨型木槌可通过分身或本体跳跃切换迷惑对手，而奥义四柱牢之术的高伤害和强制束缚效果适合终结战斗。战斗中需注意平A最后一击无浮空效果，可能被反打，因此建议衔接蛤蟆吉水铁炮或风遁·风杀阵吸附敌人后再起手。若BOSS进入狂暴状态，优先激活幻境之力天赋中的点燃+50%伤害增益，并保留奥义用于关键打断。
幻境之力的合理分配直接影响通关效率。每层通关后获得的幻境能量可用于激活天赋，推荐优先解锁追打次数增加、忍术强化等属性加成。赛季机制下，幻境能量不会清空但会按比例返还，因此长期规划天赋树尤为重要。对于50层终极挑战，建议采用追打队（如白面具宇智波斑+秽土转生鼬）或双吸队（阿飞+秽土银角），通过结界和追打联动快速积累伤害。若遇到仙自等强力敌人，可利用止水别天神控制核心目标，再集中火力击杀。
